More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1031 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 444 aa  893    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  44.64 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  46.45 
 
 		 445 aa  329  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  34.76 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  36.4 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  37.47 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  35.09 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  36.3 
 
 		 444 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  35.09 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  36.16 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  36.11 
 
 		 444 aa  252  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  38.07 
 
 		 445 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  35.68 
 
 		 447 aa  252  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  36.18 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  36.18 
 
 		 446 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  35.98 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  36.18 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  36.07 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  36.41 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  36.41 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  36.18 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  35.94 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  35.94 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  35.94 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  35.94 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  35.94 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  32.88 
 
 		 442 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  35.94 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.84 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  34.39 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 		 443 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  35.48 
 
 		 449 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  37.36 
 
 		 442 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  34.54 
 
 		 442 aa  245  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.4 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  34.54 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  35.07 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  37.07 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  34.62 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  36.88 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  35 
 
 		 450 aa  243  7e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.16 
 
 		 443 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  34.47 
 
 		 444 aa  242  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  32.73 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  33.56 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  34.25 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  32.72 
 
 		 441 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  34.4 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  34.02 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  35.7 
 
 		 442 aa  239  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  36.1 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  34.17 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  34.84 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  32.05 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  33.87 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  34.83 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  36.49 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  35.07 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  34.49 
 
 		 443 aa  236  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  34.85 
 
 		 444 aa  236  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  34.1 
 
 		 446 aa  236  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 		 441 aa  236  8e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  34.42 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  37.24 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  37.24 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  34.23 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  37.24 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  32.5 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  34.82 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  36.18 
 
 		 468 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  34.82 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 		 439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  33.63 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  34.4 
 
 		 475 aa  233  5e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  34.84 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  32.13 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  34.74 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  35.08 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  33.64 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  35.56 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  35.14 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.73 
 
 		 445 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  35.33 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.73 
 
 		 445 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.73 
 
 		 445 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  33.93 
 
 		 453 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.85 
 
 		 451 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  32.87 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  32.05 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  34.84 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  36.4 
 
 		 447 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  34.16 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  34.75 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  35.28 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>