37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0493 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  100 
 
 		 324 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  39.2 
 
 		 326 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  39.47 
 
 		 321 aa  225  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  38.87 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  31.48 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  31.29 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  30.63 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  30.09 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 329 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  33.11 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  27.19 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  27.86 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  23.92 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  30.21 
 
 		 745 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  29 
 
 		 751 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  27.81 
 
 		 756 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  27.91 
 
 		 755 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.27 
 
 		 769 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 750 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  28.62 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  29.56 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.61 
 
 		 751 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  28.21 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  28.22 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  28.22 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  28.22 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  29.22 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  25.73 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4335  hypothetical protein  25.83 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  24.45 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  23 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6100  methyltransferase type 12  26.7 
 
 		 364 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1320  hypothetical protein  25.57 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.472657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6509  hypothetical protein  25.57 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2610  hypothetical protein  23.59 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02611  geranylgeranyl diphosphate synthase, putative (JCVI)  28.16 
 
 		 645 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221  normal  0.0772164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>