19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3801 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  25.91 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  25.73 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.7 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  21.86 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  25.28 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  25.1 
 
 		 394 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  25.1 
 
 		 394 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  20.41 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  24.69 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  20.12 
 
 		 344 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  21.02 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  22.05 
 
 		 745 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  21.41 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  21.95 
 
 		 755 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  20.85 
 
 		 769 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>