35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6866 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  34.19 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  31.79 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.29 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  30.79 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  27.74 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  29.15 
 
 		 327 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  30.06 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.96 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.7 
 
 		 751 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  27.84 
 
 		 751 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.51 
 
 		 769 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  27.65 
 
 		 756 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  25.42 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  24.27 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 750 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.15 
 
 		 755 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  26.84 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  26.84 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  26.84 
 
 		 394 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  26.13 
 
 		 745 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  26.06 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.13 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  25.33 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  23 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  26.76 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  26.88 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  22.67 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  25.71 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  23.38 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2610  hypothetical protein  24.88 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  26.21 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4335  hypothetical protein  22.81 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5945  methyltransferase type 12  26.49 
 
 		 677 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>