33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6200 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  55.1 
 
 		 751 aa  808    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  51.16 
 
 		 769 aa  786    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  59 
 
 		 751 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  59.02 
 
 		 750 aa  843    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  52.41 
 
 		 745 aa  782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  100 
 
 		 755 aa  1541    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  53.98 
 
 		 756 aa  773    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.54 
 
 		 325 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  27.91 
 
 		 324 aa  97.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.79 
 
 		 326 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.45 
 
 		 327 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.49 
 
 		 326 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  22.87 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  23.31 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.12 
 
 		 344 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  24.6 
 
 		 330 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.37 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  27.13 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  30.22 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6100  methyltransferase type 12  31.05 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  24.52 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6509  hypothetical protein  29.45 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1320  hypothetical protein  29.45 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.472657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  22.26 
 
 		 329 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  22.29 
 
 		 323 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  30.07 
 
 		 373 aa  52  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  24.56 
 
 		 324 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  25.07 
 
 		 393 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  22.69 
 
 		 339 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  23.22 
 
 		 394 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  23.51 
 
 		 394 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  23.51 
 
 		 394 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  22.74 
 
 		 335 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>