26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3107 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  685    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  39.59 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2610  hypothetical protein  30.34 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.28 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  29.56 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  23.43 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.68 
 
 		 755 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  26.79 
 
 		 745 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.64 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  26.76 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.94 
 
 		 750 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.16 
 
 		 756 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.51 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  26.57 
 
 		 751 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 769 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.76 
 
 		 751 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  22.37 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.71 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.29 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.82 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  23.45 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  23.5 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6509  hypothetical protein  27.93 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1320  hypothetical protein  27.93 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.472657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  22.33 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>