30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2648 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  61.8 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  27.86 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.87 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.31 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.33 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  23.84 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  24.83 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  30 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23.48 
 
 		 769 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  24.6 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.51 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  21.04 
 
 		 745 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.79 
 
 		 756 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  21.6 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  26.52 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.29 
 
 		 755 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  26.06 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  21.82 
 
 		 750 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  21.26 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  21.47 
 
 		 751 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  23.45 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2620  hypothetical protein  27.48 
 
 		 448 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0236435  hitchhiker  0.00226971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  21.38 
 
 		 751 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  20.4 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  20.4 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  20.4 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>