39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3509 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  72.35 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  39.2 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  35.6 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  37.38 
 
 		 329 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 338 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  31.53 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  34.88 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  31.65 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  32.35 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  29.6 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  31.13 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  29.45 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  24.92 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 769 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  29.91 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  27.49 
 
 		 755 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.72 
 
 		 751 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  24.63 
 
 		 745 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  26.3 
 
 		 751 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  25.83 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.35 
 
 		 756 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  29.87 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4335  hypothetical protein  28.15 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  27.51 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  24.84 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2620  hypothetical protein  25.31 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0236435  hitchhiker  0.00226971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  27.88 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  25.33 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  25.33 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  25.33 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  22.95 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  22.98 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6100  methyltransferase type 12  24.63 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6509  hypothetical protein  24.63 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1320  hypothetical protein  24.63 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.472657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2610  hypothetical protein  24.17 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2201  putative terpene cyclase  32 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000144579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>