30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4100 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  100 
 
 		 325 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  39.24 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  36.56 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  33.43 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  30.09 
 
 		 324 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  31.13 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  28.16 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  30.6 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.99 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.34 
 
 		 329 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.54 
 
 		 755 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  24.39 
 
 		 745 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  24.16 
 
 		 751 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25 
 
 		 750 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.17 
 
 		 751 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.49 
 
 		 756 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23.71 
 
 		 769 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  23.22 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  23.59 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  25.95 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  22.62 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  24.01 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  27.21 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  22.75 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  24.06 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4335  hypothetical protein  22.89 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2620  hypothetical protein  30.4 
 
 		 448 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0236435  hitchhiker  0.00226971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  27.97 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  20 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>