28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1797 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  100 
 
 		 344 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  35.4 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  33.43 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  33.63 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  30.63 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  28.78 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 326 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  29.88 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.82 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.86 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  28.22 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  24.58 
 
 		 745 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.63 
 
 		 751 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.12 
 
 		 755 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.64 
 
 		 756 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23.78 
 
 		 750 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  23.03 
 
 		 751 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  22.81 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  21.66 
 
 		 769 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  23.32 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  22.51 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  24.29 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  22.22 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  21.69 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  20.82 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  19.65 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  20.12 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2620  hypothetical protein  23.23 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0236435  hitchhiker  0.00226971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>