29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1841 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  100 
 
 		 335 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2620  hypothetical protein  42.41 
 
 		 448 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0236435  hitchhiker  0.00226971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  38.71 
 
 		 393 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  36.94 
 
 		 373 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4614  hypothetical protein  28.32 
 
 		 361 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  22.59 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.84 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.07 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  26.74 
 
 		 751 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.07 
 
 		 756 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.22 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23.27 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  24.45 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.69 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  25.17 
 
 		 745 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  27.21 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.87 
 
 		 751 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23.48 
 
 		 769 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  20.82 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  20.97 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  21.62 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  21.02 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  23.22 
 
 		 394 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  23.22 
 
 		 394 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  23.22 
 
 		 394 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.74 
 
 		 755 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5945  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 677 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>