26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0160 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0160  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 247 aa  460  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.609273  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6208  hypothetical protein  98.38 
 
 		 247 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2913  uroporphyrinogen III synthase HEM4  82.19 
 
 		 247 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.155433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.05 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3416  uroporphyrinogen-III synthase  38.98 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  38.76 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  35.43 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.88 
 
 		 734 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.78 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  23.24 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.78 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.87 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.59 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  30.87 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  37.2 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  31.31 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1797  uroporphyrinogen-III synthase  30.5 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0201801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0892  Uroporphyrinogen-III synthase  29.59 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.48 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  34.1 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.25 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.65 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  34.3 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  28 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  34.3 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>