More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3418 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3134  Serine/threonine protein kinase  94.58 
 
 
427 aa  764    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3872  protein kinase  94.81 
 
 
424 aa  766    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0696421  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3418  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2349  serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 
616 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.769925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
698 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 
609 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0913  serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
615 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2878  serine/threonine protein kinase  42.48 
 
 
626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
611 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2441  protein kinase  38.67 
 
 
701 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.77399  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  35 
 
 
668 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3475  Serine/threonine protein kinase  35 
 
 
668 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  34.73 
 
 
621 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  34.66 
 
 
503 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
614 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 
517 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.34 
 
 
667 aa  129  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
502 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 
641 aa  128  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
513 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
706 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
651 aa  124  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
625 aa  123  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
746 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  32.58 
 
 
593 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 
1383 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.24 
 
 
499 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
1340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.79 
 
 
650 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.7 
 
 
607 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
563 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.98 
 
 
518 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 
1479 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  35.41 
 
 
477 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  35.91 
 
 
554 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 
542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 
763 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.94 
 
 
553 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.46 
 
 
967 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 
1289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.91 
 
 
528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  32.42 
 
 
615 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 
1320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
528 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  30.58 
 
 
583 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  34.08 
 
 
623 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 
464 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  36.06 
 
 
484 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.9 
 
 
598 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 
465 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 
533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1111  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.46 
 
 
741 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621151  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  35.32 
 
 
1422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
622 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
646 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  34.24 
 
 
620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.26 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 
475 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  30.15 
 
 
604 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1579  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 
761 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.222846  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  31.33 
 
 
672 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
632 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 
552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  35.96 
 
 
443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  35.09 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.95 
 
 
627 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
585 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
565 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  29.13 
 
 
614 aa  113  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.34 
 
 
666 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
707 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.08 
 
 
632 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 
581 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1096  serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 
413 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.03 
 
 
668 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.63 
 
 
1655 aa  113  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
645 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  38.21 
 
 
483 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
700 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  35.96 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
723 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.5 
 
 
591 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.92 
 
 
614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
581 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.94 
 
 
518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  33.64 
 
 
625 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.33 
 
 
740 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  35.96 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>