51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1478 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 		 330 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  36.48 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  34.93 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  31.69 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.01 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  32.2 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.33 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  33.46 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  32.31 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.88 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  34.91 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  30.89 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  35.29 
 
 		 268 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  36.46 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  38.27 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.81 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.52 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  34.97 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.79 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  29.03 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  27.92 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  31.25 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  29.32 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  35.05 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  26.36 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  27.91 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  30.72 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0856  hypothetical protein  45 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265376  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  40.98 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  60.98 
 
 		 142 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1592  HPr kinase  43.48 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  54.35 
 
 		 142 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  58.54 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1910  hypothetical protein  25.51 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  47.54 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1137  hypothetical protein  39.33 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  36.49 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  39.34 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00190  hypothetical protein  51.11 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  28.24 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  50 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  48.94 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  33.8 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  38.18 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  47.92 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  31.58 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  53.66 
 
 		 162 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  34.92 
 
 		 140 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  45.65 
 
 		 154 aa  43.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1155  HPr kinase  33.96 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  36.36 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>