More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0627 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0627  glycosyl transferase family 4  100 
 
 		 363 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0689  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase transmembrane protein  66.2 
 
 		 373 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3985  glycosyl transferase family protein  62.81 
 
 		 368 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0858  glycosyl transferase family protein  61.71 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0409  glycosyl transferase family protein  61.71 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0903  glycosyl transferase family 4  63.09 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0767  glycosyl transferase family protein  61.98 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0778  glycosyl transferase family protein  61.98 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0888  glycosyl transferase family protein  61.71 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2288  glycosyl transferase family protein  62.53 
 
 		 366 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2502  glycosyl transferase family protein  62.53 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3125  glycosyl transferase, group 4 family protein  61.98 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2196  glycosyl transferase family protein  61.98 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3149  glycosyl transferase family protein  61.98 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3088  glycosyl transferase, group 4 family protein  61.98 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2069  glycosyl transferase family protein  61.98 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.2071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2545  glycosyl transferase family protein  61.98 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0711  glycosyl transferase family protein  61.98 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1484  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  61.71 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3732  putative undecaprenyl phosphate N- acetylglucosaminyltransferase  62.81 
 
 		 366 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1270  glycosyl transferase family protein  51.4 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.989667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0618  glycosyl transferase family protein  51.94 
 
 		 373 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0261116 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0349  glycosyl transferase family 4  48.75 
 
 		 366 aa  341  9e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.281434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4714  glycosyl transferase family 4  50.56 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0630  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  53.85 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.336958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0567  glycosyl transferase family 4  44.23 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0772  glycosyl transferase family 4  44.44 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1227  glycosyl transferase family protein  44.2 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1320  glycosyl transferase family protein  44.32 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0587  glycosyl transferase family protein  44.58 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493903  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0316  glycosyl transferase family protein  40.55 
 
 		 360 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.767969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3998  glycosyl transferase family protein  42.05 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4140  glycosyl transferase family protein  42.08 
 
 		 367 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022778 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1884  glycosyl transferase family protein  40.71 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1886  glycosyl transferase family protein  44.9 
 
 		 362 aa  222  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0647  glycosyl transferase family protein  43.32 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.029233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3131  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4092  hypothetical protein  33.46 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.143855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2342  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 542 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.88 
 
 		 600 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  31.91 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  30.29 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  29.75 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  35.88 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  33.11 
 
 		 349 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 545 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 591 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1975  putative glycosyl transferase, family 4  42.45 
 
 		 176 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.15 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.3 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  26.16 
 
 		 554 aa  93.6  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.86 
 
 		 329 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 		 496 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  33.33 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 521 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  32.09 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.45 
 
 		 441 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.45 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  30.15 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  26.98 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  31.05 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  31.7 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.32 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.79 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  26.32 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  26.32 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.71 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.96 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.88 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.96 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  29.17 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.55 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  28.06 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.67 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1662  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  30.07 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.03 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.88 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  25.88 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  30.07 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  26.67 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  30.07 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3910  glycosyl transferase family 4  29.92 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.993379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>