152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4558 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4558  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4560  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.24 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4557  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.98 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0576  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.65 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0761452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2609  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.27 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3019  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.27 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.513335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2774  magnesium/cobalt transporter CorA  21.86 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2853  magnesium/cobalt transporter CorA  22.86 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0973  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.27 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4292  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.8 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3905  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.8 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3613  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.8 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3052  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.86 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.14 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2490  magnesium and cobalt transport protein CorA  31 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1270  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.14 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.932061  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1589  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.78 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4931  Mg2 transporter protein CorA family protein  30 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1168  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.14 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1958  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.11 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000232842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3322  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.22 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2334  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.78 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0224869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2550  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.51 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0926  magnesium/cobalt transport protein  25.81 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2353  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2690  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.93 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.4769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2809  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.71 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0134  magnesium/cobalt transporter CorA  27.08 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000744017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1645  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000211085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3948  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.83 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1786  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.12 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3297  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.83 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3823  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.8 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0550  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.22 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1941  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00013854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.387047  normal  0.185516 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1537  magnesium and cobalt transport protein CorA  31 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1846  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0143236  hitchhiker  0.00262704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2505  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0104168  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2259  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4090  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.14 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2498  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0365277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2618  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240345  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4615  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.64 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0507  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.85 
 
 		 330 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0237  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  30.08 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  30.08 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.318562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0214  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.45 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0551  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.45 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4002  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.45 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1034  magnesium and cobalt transporter, putative  29.37 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00652264  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3748  magnesium and cobalt transport protein CorA  23 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4290  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.73 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3978  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  29.27 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000688166  normal  0.660189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03692  magnesium/nickel/cobalt transporter  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4163  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5256  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03641  hypothetical protein  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4281  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.61 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4041  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4335  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1722  magnesium and cobalt transport protein CorA  30 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.992211  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4192  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.846317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4183  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0470  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.68 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4339  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4181  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4280  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4162  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2459  putative magnesium/cobalt transport protein  25.51 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2476  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.73 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245937  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4232  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  25.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1883  magnesium/cobalt transporter CorA  32.43 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.69 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4159  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.33 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3795  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.67 
 
 		 336 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.760461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1280  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.95 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3969  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.33 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.58 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0675  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.36 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0016  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.72 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.72 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.636656  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0762  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.47 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0819576  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0106  Mg2 transporter protein CorA family protein  46.81 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000184046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0443  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.47 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6010  magnesium/cobalt transport protein  24.21 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1735  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.69 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942891  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0401  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.3 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0536  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.65 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.18 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.22 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0826  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.75 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.922261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69570  magnesium/cobalt transport protein  23.68 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0054645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0227  transport protein  25.83 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.93 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0749  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.75 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.680593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>