More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2774 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2774  magnesium/cobalt transporter CorA  100 
 
 
320 aa  646    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2609  magnesium and cobalt transport protein CorA  96.56 
 
 
320 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3019  magnesium and cobalt transport protein CorA  96.25 
 
 
320 aa  627  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.513335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2853  magnesium/cobalt transporter CorA  88.12 
 
 
320 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3052  magnesium and cobalt transport protein CorA  88.12 
 
 
320 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0220  magnesium and cobalt transport protein CorA  75.7 
 
 
321 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0241  magnesium and cobalt transport protein CorA  76.32 
 
 
321 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3297  magnesium and cobalt transport protein CorA  60.37 
 
 
328 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3948  magnesium and cobalt transport protein CorA  60.67 
 
 
328 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643158  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0227  transport protein  62.07 
 
 
318 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4572  magnesium and cobalt transport protein CorA  59.45 
 
 
328 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0401  magnesium and cobalt transport protein CorA  60.67 
 
 
328 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2550  magnesium and cobalt transport protein CorA  59.45 
 
 
328 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4615  magnesium and cobalt transport protein CorA  60.67 
 
 
328 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3748  magnesium and cobalt transport protein CorA  57.93 
 
 
328 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3795  magnesium and cobalt transport protein CorA  60.37 
 
 
336 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.760461  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0470  magnesium and cobalt transport protein CorA  58.75 
 
 
320 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0973  magnesium and cobalt transport protein CorA  59.45 
 
 
328 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2980  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  48.92 
 
 
450 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3905  Mg2+ transporter protein, CorA-like  47.81 
 
 
461 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4162  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.38 
 
 
316 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4280  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.38 
 
 
316 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4339  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.38 
 
 
316 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4181  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.38 
 
 
316 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4232  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.38 
 
 
316 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03692  magnesium/nickel/cobalt transporter  44.06 
 
 
316 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4163  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.06 
 
 
316 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4041  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.06 
 
 
316 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4192  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.06 
 
 
316 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.846317 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4335  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.06 
 
 
316 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4281  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.06 
 
 
316 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4183  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.06 
 
 
316 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0150126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5256  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.06 
 
 
316 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03641  hypothetical protein  44.06 
 
 
316 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4159  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.38 
 
 
316 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3969  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.75 
 
 
316 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.75 
 
 
316 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.318562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3978  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.12 
 
 
316 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000688166  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.75 
 
 
316 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0128  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.06 
 
 
316 aa  261  1e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.273225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0237  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  42.81 
 
 
316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4090  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.93 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0551  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.12 
 
 
316 aa  258  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4002  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.12 
 
 
316 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0214  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.12 
 
 
316 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1659  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.89 
 
 
316 aa  246  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000570011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.24 
 
 
317 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.636656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0016  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.24 
 
 
317 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1722  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.16 
 
 
315 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.992211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1786  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.32 
 
 
315 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2490  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.59 
 
 
315 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2498  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.27 
 
 
315 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0365277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2618  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.27 
 
 
315 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240345  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1846  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.27 
 
 
315 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0143236  hitchhiker  0.00262704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2505  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.27 
 
 
315 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.01 
 
 
315 aa  221  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.387047  normal  0.185516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1941  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.69 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2259  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.93 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.38 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00013854  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2334  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.59 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0224869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1645  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.38 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000211085  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1537  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.27 
 
 
315 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34242  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2809  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.12 
 
 
315 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2353  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.96 
 
 
315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.41 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1589  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.15 
 
 
320 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2080  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.4 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.14 
 
 
331 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3322  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.36 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0134  magnesium/cobalt transporter CorA  34.71 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000744017  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0245  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.67 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279376  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0443  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.34 
 
 
325 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.4 
 
 
331 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3905  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.76 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3613  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.76 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0507  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.88 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4292  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.73 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2459  putative magnesium/cobalt transport protein  31.9 
 
 
325 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3823  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.75 
 
 
334 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452482  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2476  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.88 
 
 
324 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245937  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0550  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.22 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0310  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.23 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1270  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.44 
 
 
326 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.932061  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4290  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.31 
 
 
326 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0762  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.28 
 
 
326 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0819576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2690  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.71 
 
 
317 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.4769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
316 aa  175  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6010  magnesium/cobalt transport protein  32.32 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69570  magnesium/cobalt transport protein  32.32 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0054645  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1280  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.8 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4931  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.75 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1168  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.46 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.33 
 
 
321 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0855  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.42 
 
 
330 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0826  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 
327 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.922261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1883  magnesium/cobalt transporter CorA  34.55 
 
 
331 aa  169  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0749  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.12 
 
 
327 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.680593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3288  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.87 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0926  magnesium/cobalt transport protein  34.19 
 
 
313 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3423  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.56 
 
 
328 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.707435  normal  0.494677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>