More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0926 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0926  magnesium/cobalt transport protein  100 
 
 		 313 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0550  Mg2 transporter protein CorA family protein  62.62 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0507  Mg2 transporter protein CorA family protein  62.09 
 
 		 330 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0443  magnesium and cobalt transport protein CorA  63.43 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0245  Mg2 transporter protein CorA family protein  47.7 
 
 		 319 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2459  putative magnesium/cobalt transport protein  43.97 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3823  Mg2 transporter protein CorA family protein  46.54 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3613  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.51 
 
 		 334 aa  278  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3905  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.51 
 
 		 334 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.85 
 
 		 331 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4292  Mg2 transporter protein CorA family protein  45.81 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.85 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4931  Mg2 transporter protein CorA family protein  45.1 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4290  Mg2+ transporter protein, CorA-like  44.08 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1168  Mg2+ transporter protein, CorA-like  43.79 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0762  Mg2+ transporter protein, CorA-like  44.87 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0819576  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.63 
 
 		 321 aa  265  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2476  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.52 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245937  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1270  Mg2+ transporter protein, CorA-like  43.45 
 
 		 326 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.932061  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1883  magnesium/cobalt transporter CorA  44.52 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0559  CorA family protein  41.42 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.780327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0560  CorA family protein  41.42 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.856188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6010  magnesium/cobalt transport protein  39.81 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69570  magnesium/cobalt transport protein  40.26 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0054645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2704  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.83 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1204  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.66 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.787899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47640  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.63 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.505114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0855  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.19 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0310  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.19 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1967  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.92 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3423  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.6 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.707435  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1589  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.33 
 
 		 320 aa  188  9e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1659  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  39.02 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000570011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0237  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.54 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4090  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.19 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0551  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.54 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0214  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.54 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4002  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.54 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3978  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.96 
 
 		 316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000688166  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4280  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.29 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4232  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.29 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4339  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.29 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4162  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.29 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.54 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.318562  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4181  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  37.29 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03692  magnesium/nickel/cobalt transporter  36.96 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4163  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.96 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03641  hypothetical protein  36.96 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5256  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.96 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4281  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.96 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4192  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.96 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.846317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4183  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.96 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4041  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.96 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4335  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.96 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3322  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.58 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4159  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.88 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3969  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.54 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0134  magnesium/cobalt transporter CorA  35.1 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000744017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0016  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.39 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.39 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.636656  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0128  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.01 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.273225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  36.88 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3795  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.78 
 
 		 336 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.760461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2774  magnesium/cobalt transporter CorA  34.19 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5327  Mg2 transporter protein CorA family protein  35 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2609  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.12 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5251  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.74 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4784  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.74 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3019  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.12 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.513335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2334  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.31 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0224869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3052  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.78 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2608  Mg2+/Co2+ transporter  35.1 
 
 		 331 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3748  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.05 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1266  Fis family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 331 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2690  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.67 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.4769  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.8 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0675  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.09 
 
 		 324 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1769  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.18 
 
 		 325 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4615  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.41 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2853  magnesium/cobalt transporter CorA  33.44 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0536  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.58 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3297  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.37 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3948  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.37 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4572  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.76 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2550  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.12 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0227  transport protein  35.12 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0470  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.67 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0973  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1786  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.67 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2490  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.11 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0401  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.26 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1722  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.56 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.992211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2809  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.67 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1537  magnesium and cobalt transport protein CorA  32 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0241  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.77 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0220  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.21 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1280  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.18 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.67 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00013854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2353  magnesium and cobalt transport protein CorA  32 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>