More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0017 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 		 317 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.636656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0016  magnesium and cobalt transport protein CorA  99.05 
 
 		 317 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4090  magnesium and cobalt transport protein CorA  73.82 
 
 		 317 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4159  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.65 
 
 		 316 aa  288  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03692  magnesium/nickel/cobalt transporter  48.28 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4163  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.28 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4183  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  48.28 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5256  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  48.28 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4281  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  48.28 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4335  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  48.28 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4041  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  48.28 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03641  hypothetical protein  48.28 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4192  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  48.28 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.846317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.34 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.318562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3969  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.34 
 
 		 316 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4232  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.65 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4280  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.65 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4162  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.65 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.34 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4339  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.65 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4181  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.65 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0551  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  46.71 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4002  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  46.71 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0214  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  46.71 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0237  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  46.39 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3978  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  46.71 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000688166  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0128  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  45.14 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.273225  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1659  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  47.19 
 
 		 316 aa  272  7e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000570011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1722  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.7 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.992211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1537  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.17 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2490  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.21 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2334  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.17 
 
 		 315 aa  259  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0224869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1786  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.21 
 
 		 315 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1941  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.17 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2259  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.7 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2618  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.83 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240345  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2498  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.83 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0365277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1846  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.83 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0143236  hitchhiker  0.00262704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2809  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.69 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.83 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00013854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2505  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.83 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.17 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.387047  normal  0.185516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2353  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.14 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1645  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.83 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000211085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2609  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.99 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2853  magnesium/cobalt transporter CorA  42.86 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3019  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.99 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.513335 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3052  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.86 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2774  magnesium/cobalt transporter CorA  42.24 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0227  transport protein  45.62 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0220  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.88 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0241  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.25 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4615  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.9 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4572  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.55 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3795  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.51 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.760461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0470  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.41 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3748  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.99 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2550  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.68 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3948  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.99 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0973  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.68 
 
 		 328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3297  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.99 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2080  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.21 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0401  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.6 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.95 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0443  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.86 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.38 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0507  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.38 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69570  magnesium/cobalt transport protein  38.05 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0054645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0550  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.38 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6010  magnesium/cobalt transport protein  37.71 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1589  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.31 
 
 		 320 aa  186  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2690  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.4769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4290  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.32 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2459  putative magnesium/cobalt transport protein  32.93 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0762  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.62 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0819576  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0926  magnesium/cobalt transport protein  36.7 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1883  magnesium/cobalt transporter CorA  39.46 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.85 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0134  magnesium/cobalt transporter CorA  34.49 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000744017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1168  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.52 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2476  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.84 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245937  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0245  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.88 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0310  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.44 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.35 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3823  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.63 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2704  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.53 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47640  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.45 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.505114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1270  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.63 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.932061  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3905  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.77 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3613  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.77 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3322  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.45 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4931  Mg2 transporter protein CorA family protein  31 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4292  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.32 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3288  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.41 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2980  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  37.1 
 
 		 450 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0855  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.04 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.86 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3423  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.42 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.707435  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3905  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.31 
 
 		 461 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0560  CorA family protein  29.43 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.856188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>