More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4290 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4290  Mg2+ transporter protein, CorA-like  100 
 
 		 326 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0762  Mg2+ transporter protein, CorA-like  82.52 
 
 		 326 aa  564  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0819576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1168  Mg2+ transporter protein, CorA-like  77.61 
 
 		 326 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1270  Mg2+ transporter protein, CorA-like  77.91 
 
 		 326 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.932061  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2459  putative magnesium/cobalt transport protein  76.69 
 
 		 325 aa  520  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4931  Mg2 transporter protein CorA family protein  74.23 
 
 		 326 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2476  Mg2 transporter protein CorA family protein  50 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245937  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  50.92 
 
 		 321 aa  315  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4292  Mg2 transporter protein CorA family protein  49.39 
 
 		 334 aa  315  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.76 
 
 		 331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3905  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.77 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3613  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.77 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3823  Mg2 transporter protein CorA family protein  50.8 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.18 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1883  magnesium/cobalt transporter CorA  52 
 
 		 331 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0245  Mg2 transporter protein CorA family protein  50.99 
 
 		 319 aa  298  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0855  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.25 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0550  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.94 
 
 		 325 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0443  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.4 
 
 		 325 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0507  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.69 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2704  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.42 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0560  CorA family protein  40 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.856188  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0559  CorA family protein  40 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.780327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6010  magnesium/cobalt transport protein  40.55 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1204  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.36 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.787899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0926  magnesium/cobalt transport protein  43.75 
 
 		 313 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69570  magnesium/cobalt transport protein  40.24 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0054645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2608  Mg2+/Co2+ transporter  40.91 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47640  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.98 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.505114  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1266  Fis family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1967  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.06 
 
 		 324 aa  239  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3423  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.66 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.707435  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0310  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.7 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5251  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.69 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4784  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.69 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5327  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.02 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3795  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.71 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.760461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0675  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.5 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1589  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.23 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3948  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.12 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3748  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3297  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.83 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1769  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.92 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0536  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.05 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4615  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.74 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1537  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.87 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2334  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.18 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0224869  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.2 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00013854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4572  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.74 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1846  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.85 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0143236  hitchhiker  0.00262704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2853  magnesium/cobalt transporter CorA  32.83 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2498  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.85 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0365277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3978  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.44 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000688166  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.01 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2618  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.85 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240345  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2505  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.85 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0104168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1941  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.87 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3052  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.22 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1645  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.2 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000211085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0973  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.39 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0227  transport protein  35 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.87 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.387047  normal  0.185516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03692  magnesium/nickel/cobalt transporter  33.77 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4163  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.77 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4090  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.7 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03641  hypothetical protein  33.77 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4192  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.77 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.846317 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4335  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.77 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4183  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.77 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4041  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.77 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4281  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.77 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5256  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.77 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0237  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.33 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4339  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.44 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4232  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.44 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4181  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.44 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4162  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.44 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4280  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.44 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3019  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.12 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.513335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  32.11 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2080  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.92 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2774  magnesium/cobalt transporter CorA  31.31 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2259  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.21 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.55 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.318562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2809  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.43 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2609  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.52 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0551  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  32.47 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0214  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  32.47 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4002  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  32.47 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4159  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.6 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1722  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.88 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.992211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.32 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.636656  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1659  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.05 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000570011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0401  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.83 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3969  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.6 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2490  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.1 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2550  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.72 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2353  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.85 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1786  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.21 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0016  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.01 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>