More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3969 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4159  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  98.73 
 
 		 316 aa  636    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3969  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  100 
 
 		 316 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  93.35 
 
 		 316 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  92.72 
 
 		 316 aa  607  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.318562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0237  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  91.14 
 
 		 316 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0214  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  91.46 
 
 		 316 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0551  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  91.46 
 
 		 316 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4002  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  91.46 
 
 		 316 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03692  magnesium/nickel/cobalt transporter  89.56 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4163  magnesium and cobalt transport protein CorA  89.56 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4183  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.56 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4281  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.56 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4041  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.56 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4335  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.56 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4192  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.56 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.846317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5256  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.56 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03641  hypothetical protein  89.56 
 
 		 316 aa  590  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4280  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.87 
 
 		 316 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4232  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.87 
 
 		 316 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4162  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.87 
 
 		 316 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4181  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.87 
 
 		 316 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4339  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  89.87 
 
 		 316 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3978  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  88.61 
 
 		 316 aa  581  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000688166  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0128  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  79.11 
 
 		 316 aa  531  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.273225  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1659  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  73.1 
 
 		 316 aa  459  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000570011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4090  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.99 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.34 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.636656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0016  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.71 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2853  magnesium/cobalt transporter CorA  44.06 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2774  magnesium/cobalt transporter CorA  43.75 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3019  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.12 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.513335 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3052  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.24 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2609  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.12 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1537  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.26 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1941  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.32 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2259  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.63 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.32 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.387047  normal  0.185516 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1722  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.63 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.992211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2498  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.63 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0365277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2618  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.63 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240345  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1846  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.63 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0143236  hitchhiker  0.00262704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2505  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.63 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0104168  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3297  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.51 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2353  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.95 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3948  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.51 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1645  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.69 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000211085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.69 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00013854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2550  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.12 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2334  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.69 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0224869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2490  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.63 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1786  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.69 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0220  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.68 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0241  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.99 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2809  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.75 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4572  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.37 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3748  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.9 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0227  transport protein  43.75 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0973  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.9 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0470  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.44 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3795  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.9 
 
 		 336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.760461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0401  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.82 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4615  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.47 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2080  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.42 
 
 		 315 aa  215  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.22 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2980  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  39.17 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.79 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.12 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3905  Mg2+ transporter protein, CorA-like  36.48 
 
 		 461 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.58 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2690  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.48 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.4769  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0245  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.73 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3905  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.69 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3613  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.69 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4292  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.69 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1589  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.71 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0134  magnesium/cobalt transporter CorA  34.39 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000744017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2459  putative magnesium/cobalt transport protein  32.31 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.56 
 
 		 316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1883  magnesium/cobalt transporter CorA  35.28 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0550  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.74 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1270  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.44 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.932061  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3823  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.62 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1168  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0507  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.96 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0443  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.56 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4290  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.6 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69570  magnesium/cobalt transport protein  31.91 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0054645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0926  magnesium/cobalt transport protein  35.79 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3322  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.54 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6010  magnesium/cobalt transport protein  31.91 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0762  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.93 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0819576  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0855  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.13 
 
 		 330 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3288  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.88 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2476  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.44 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245937  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47640  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.505114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4931  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.83 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1280  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.41 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0749  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.72 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.680593  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2704  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.02 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0826  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.72 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.922261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>