163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2650 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2650  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  801    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2718  protein of unknown function UPF0052 and CofD  90.4 
 
 		 396 aa  727    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1995  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.27 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  35.04 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.76 
 
 		 314 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.76 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.29 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  36.31 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  33.77 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.89 
 
 		 428 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  30.72 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  32.89 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  31.42 
 
 		 457 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.05 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  30.56 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.16 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  30.77 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  27.81 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.02 
 
 		 324 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  31.9 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  36.1 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.35 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.33 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.92 
 
 		 325 aa  100  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.8 
 
 		 434 aa  99.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  36.67 
 
 		 448 aa  99.8  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.28 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.63 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.26 
 
 		 463 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  35.83 
 
 		 465 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  35.83 
 
 		 465 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.33 
 
 		 443 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  29.39 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.08 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.08 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  30.74 
 
 		 502 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.8 
 
 		 350 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.43 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  50 
 
 		 444 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.52 
 
 		 317 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.52 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.21 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  39.34 
 
 		 331 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  39.34 
 
 		 331 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  39.39 
 
 		 317 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.22 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  39.39 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  36.84 
 
 		 321 aa  90.5  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  39.39 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.16 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  35.06 
 
 		 316 aa  89.7  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.32 
 
 		 317 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  39.39 
 
 		 317 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  39.39 
 
 		 317 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  39.39 
 
 		 317 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.83 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  39.39 
 
 		 317 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  39.34 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  32.75 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  33.05 
 
 		 324 aa  87.4  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.17 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  34.66 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.41 
 
 		 457 aa  87  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.63 
 
 		 310 aa  86.7  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  29.63 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  33.47 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  48.84 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  41.59 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1782  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.43 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  32.56 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.78 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  32.39 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  32.6 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  43.53 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  29.33 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.75 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.8 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.7 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  44.87 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2645  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.84 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  37.89 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.18 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  27.73 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  34.62 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.73 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.73 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1403  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.94 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0067064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.36 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  33.14 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  45.12 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.27 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1825  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.86 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.5 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.55 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.84 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  38.46 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.56 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  36 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2061  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>