81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2065 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  868    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17420  hypothetical protein  59.12 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.448731  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2994  hypothetical protein  54.63 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  53.76 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1614  hypothetical protein  36.36 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190402  normal  0.863337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2173  hypothetical protein  34.64 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  33.49 
 
 		 894 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  34.36 
 
 		 909 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  35.98 
 
 		 888 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  25.23 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  31.84 
 
 		 902 aa  87  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  24.68 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  24.68 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4262  hypothetical protein  27.7 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.905098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  30.12 
 
 		 1324 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  30.1 
 
 		 1309 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1046 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  29.48 
 
 		 1326 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  47.76 
 
 		 1311 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  29.27 
 
 		 1314 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  56.25 
 
 		 1017 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  27.17 
 
 		 255 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  31.65 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.12 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.38 
 
 		 257 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  26.38 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.94 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  26.38 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3447  cell division inhibitor  22.38 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2669  ParA family protein  22.38 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.09 
 
 		 259 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.29 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 		 257 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2798  cell division inhibitor  22.91 
 
 		 251 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.208643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.2 
 
 		 259 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3570  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 		 265 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00412685  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  40.91 
 
 		 279 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  26.79 
 
 		 1098 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1399  septum site-determining protein MinD  28.16 
 
 		 264 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000334804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.68 
 
 		 911 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  35.14 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.59 
 
 		 256 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  24.19 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  27.16 
 
 		 735 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 346 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2864  hypothetical protein  26.7 
 
 		 905 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0981058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.66 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00448287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01985  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family  31.82 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.186149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.4 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2979  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.94 
 
 		 257 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.39 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.26 
 
 		 257 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.26 
 
 		 257 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  41.82 
 
 		 273 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  28 
 
 		 269 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000178028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  28 
 
 		 269 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000643693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.63 
 
 		 254 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  51.22 
 
 		 267 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.68 
 
 		 270 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.9 
 
 		 265 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 316 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  27.92 
 
 		 267 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  45.16 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  27.43 
 
 		 269 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  31.43 
 
 		 291 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01495  oxyanion-translocating ATPase  50 
 
 		 582 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  27.43 
 
 		 269 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184306  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  34.43 
 
 		 296 aa  43.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  27.43 
 
 		 269 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000037885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  39.71 
 
 		 278 aa  43.1  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  37.14 
 
 		 358 aa  43.1  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  27.81 
 
 		 269 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1894  septum site-determining protein MinD  27.43 
 
 		 269 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000304586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  27.43 
 
 		 269 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000001062  normal  0.370789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>