23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1468 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 341 aa  686    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2168  transcriptional regulator-like protein  82.4 
 
 		 341 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  hitchhiker  0.000000957386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1026  hypothetical protein  60.47 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0236  transcriptional regulator-like protein  41.49 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4261  hypothetical protein  40.3 
 
 		 342 aa  222  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3020  transcriptional regulator-like protein  41.69 
 
 		 352 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.117802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2683  transcriptional regulator-like protein  40.59 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2643  hypothetical protein  59.48 
 
 		 136 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0187479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1577  hypothetical protein  54.76 
 
 		 136 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000129101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  23.34 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  21.21 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  25.46 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.11 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  30.77 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.86 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  29.08 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  20.67 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  28.91 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  26.8 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  19.3 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.63 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  29.25 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>