More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6005 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  100 
 
 		 645 aa  1320    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  33.24 
 
 		 379 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  30.71 
 
 		 382 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  32.97 
 
 		 387 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  33.24 
 
 		 375 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  32.96 
 
 		 381 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0830  heat shock protein DnaJ-like  32.77 
 
 		 365 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  32.13 
 
 		 379 aa  161  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  31.59 
 
 		 384 aa  161  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  32.41 
 
 		 379 aa  161  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  32.13 
 
 		 379 aa  161  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  31.86 
 
 		 368 aa  160  7e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  34.15 
 
 		 371 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  34.69 
 
 		 374 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  34.42 
 
 		 374 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  31.44 
 
 		 377 aa  157  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  32.69 
 
 		 380 aa  156  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  29.49 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50996  predicted protein  32.13 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  31.23 
 
 		 380 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  31.27 
 
 		 382 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  31.68 
 
 		 383 aa  154  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  31.52 
 
 		 388 aa  154  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  31.15 
 
 		 381 aa  153  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  30.98 
 
 		 376 aa  153  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  30.71 
 
 		 374 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  30.98 
 
 		 373 aa  152  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  29.82 
 
 		 379 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4726  DnaJ central region:heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  33.43 
 
 		 321 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  29.82 
 
 		 379 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  32.04 
 
 		 366 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  30.58 
 
 		 380 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0871  heat shock protein DnaJ  32.37 
 
 		 387 aa  151  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.255126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  32.4 
 
 		 373 aa  151  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  30.32 
 
 		 375 aa  151  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  28.8 
 
 		 385 aa  150  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  30.68 
 
 		 374 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  32.7 
 
 		 378 aa  150  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  30.11 
 
 		 382 aa  150  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  30.11 
 
 		 382 aa  150  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  30.83 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  30.83 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  30.83 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  30.83 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  30.83 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  30.83 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  30.83 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  30.83 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  31.46 
 
 		 330 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  30.83 
 
 		 376 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  32.02 
 
 		 375 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  32.23 
 
 		 380 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  30.58 
 
 		 371 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  30.54 
 
 		 361 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  32.07 
 
 		 375 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  30 
 
 		 375 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  31.33 
 
 		 374 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  32.05 
 
 		 373 aa  148  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  29.06 
 
 		 385 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  30.25 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  31.12 
 
 		 381 aa  147  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  30.92 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  30.92 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  30.92 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  30.92 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  30.92 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  30.3 
 
 		 371 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  30.3 
 
 		 371 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0589  heat shock protein DnaJ domain protein  29.06 
 
 		 347 aa  147  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00109481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  30.3 
 
 		 371 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  30.17 
 
 		 377 aa  147  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  29.19 
 
 		 382 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  31.73 
 
 		 388 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  30.47 
 
 		 372 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  30.3 
 
 		 371 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0337  chaperone protein DnaJ  30.14 
 
 		 379 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  31.2 
 
 		 382 aa  147  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  31.17 
 
 		 386 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  30.3 
 
 		 371 aa  146  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  30.3 
 
 		 371 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  30.58 
 
 		 378 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  30.3 
 
 		 371 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  30.83 
 
 		 386 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  30.58 
 
 		 378 aa  146  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  32.01 
 
 		 374 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  31.39 
 
 		 368 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  30.3 
 
 		 371 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  31.89 
 
 		 355 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  30.94 
 
 		 375 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  32.01 
 
 		 374 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  32.01 
 
 		 374 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  31.2 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  31.69 
 
 		 379 aa  145  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  29.64 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  31.46 
 
 		 380 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  31.1 
 
 		 379 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  30.7 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.86 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  30.05 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  30.28 
 
 		 380 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>