More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5510 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5510  beta-ketoadipyl CoA thiolase  100 
 
 		 402 aa  814    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1470  acetyl-CoA acetyltransferase  66.5 
 
 		 404 aa  544  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 		 401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2753  acetyl-CoA acetyltransferase  61.19 
 
 		 401 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2591  acetyl-CoA acetyltransferase  63.18 
 
 		 401 aa  511  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42090  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 		 401 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  62.19 
 
 		 401 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  61.35 
 
 		 402 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  60.35 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000180504  hitchhiker  0.0045397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  61.69 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5873  acetyl-CoA acetyltransferase  59.46 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4371  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3015  acetyl-CoA acetyltransferase  60.7 
 
 		 401 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554665  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  56.97 
 
 		 403 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10876  acetyl-CoA acetyltransferase  57.86 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0134606  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4493  acetyl-CoA acetyltransferase  57.86 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4580  acetyl-CoA acetyltransferase  57.86 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4458  acetyl-CoA acetyltransferase  58.96 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1691  acetyl-CoA acetyltransferase  57.61 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4563  acetyl-CoA acetyltransferases  58.31 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.274398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0916  acetyl-CoA acetyltransferases  58.71 
 
 		 403 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4876  acetyl-CoA acetyltransferase  57.61 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.038952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1517  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1540  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5067  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 		 403 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  58.71 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.955606  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2943  acetyl-CoA acetyltransferase  58.1 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0464  acetyl-CoA acetyltransferase  55.22 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5262  acetyl-CoA acetyltransferase  59.46 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30250  acetyl-CoA acetyltransferase  56.72 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.674697 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4928  acetyl-CoA acetyltransferase  55.25 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.5477 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3851  acetyl-CoA acetyltransferase  55.25 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  55.72 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4182  acetyl-CoA acetyltransferase  56.08 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  54.84 
 
 		 403 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0061  acetyl-CoA acetyltransferase  56 
 
 		 500 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1538  acetyl-CoA acetyltransferase  55.39 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.697645  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1186  acetyl-CoA acetyltransferase  55.14 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3568  acetyl-CoA acetyltransferase  53.73 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.996401  normal  0.399886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0003  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0872  acetyl-CoA acetyltransferase  54.84 
 
 		 403 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0901574  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0794  acetyl-CoA acetyltransferase  52.99 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1398  acetyl-CoA acetyltransferase  54.89 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0745  acetyl-CoA acetyltransferase  52.99 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3244  acetyl-CoA acetyltransferase  53.48 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.0367411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3279  acetyl-CoA acetyltransferase  54.48 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0286  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 617 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7185  acetyl-CoA acetyltransferase  55.72 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2729  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  53.23 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2295  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4032  acetyl-CoA acetyltransferase  52.74 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126529  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2870  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5240  acetyl-CoA acetyltransferase  54.98 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3440  acetyl-CoA acetyltransferase  53.23 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1823  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516733  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0072  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0214  acetyl-CoA acetyltransferase  51.74 
 
 		 402 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0341  acetyl-CoA acetyltransferase  54.95 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0242  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 		 402 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1657  acetyl-CoA acetyltransferase  54 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0281  thiolase  52.24 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0022  acetyl-CoA acetyltransferase  51.99 
 
 		 402 aa  421  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.899492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0598  acetyl-CoA acetyltransferase  50.5 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1561  acetyl-CoA acetyltransferase  52.11 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.332281  normal  0.704094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0542  acetyl-CoA acetyltransferases  53.23 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0376899  normal  0.0679455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4605  acetyl-CoA acetyltransferase  51.24 
 
 		 402 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2975  acetyl-CoA acetyltransferase  52.36 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00597793  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3891  acetyl-CoA acetyltransferase  56.47 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201357  normal  0.156596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0736  acetyl-CoA acetyltransferase  51.49 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0145  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267922  normal  0.198223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0836  acetyl-CoA acetyltransferase  53.1 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0805  acetyl-CoA acetyltransferase  51.99 
 
 		 402 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  51.49 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  53.27 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0886  acetyl-CoA acetyltransferase  51.74 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679182  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0090  acetyl-CoA acetyltransferase  47.6 
 
 		 414 aa  359  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.945472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4151  acetyl-CoA acetyltransferase  45.69 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409684  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4830  acetyl-CoA acetyltransferase  45.45 
 
 		 417 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3991  acetyl-CoA acetyltransferase  45.93 
 
 		 417 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3619  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 		 412 aa  351  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  47.93 
 
 		 410 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1244  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 		 415 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.023257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1771  acetyl-CoA acetyltransferase  45.93 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2349  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1637  acetyl-CoA acetyltransferase  45.08 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.322662  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  44.94 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  45.59 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  43.21 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  44.61 
 
 		 397 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 383 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  42.75 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  43.78 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  43.72 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  42.96 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  42.22 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>