240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2527 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
139 aa  291  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  63.77 
 
 
138 aa  197  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  65.22 
 
 
138 aa  194  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  63.77 
 
 
138 aa  189  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  61.31 
 
 
139 aa  184  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  60.14 
 
 
138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  57.46 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  57.35 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  54.89 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  57.35 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  56.06 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  56.62 
 
 
138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  54.89 
 
 
136 aa  151  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  53.44 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  53.91 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  51.56 
 
 
137 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  54.69 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  53.08 
 
 
141 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  51.59 
 
 
141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  37.4 
 
 
322 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  39.84 
 
 
141 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  39.84 
 
 
141 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  39.84 
 
 
141 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  36.92 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  38.52 
 
 
326 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  36.76 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  37.78 
 
 
332 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  37.78 
 
 
332 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 
335 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  38.1 
 
 
151 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  35.51 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  35.2 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  33.06 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  35.71 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  39.57 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  32.86 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  42.7 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  32.86 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  36.51 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  29.63 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.33 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.86 
 
 
470 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  38.06 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  49.28 
 
 
343 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  30.6 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  37.12 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  46.58 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  33.81 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.83 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  47.14 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.61 
 
 
472 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  47.83 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.83 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.14 
 
 
464 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  47.83 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  34.53 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  47.83 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.81 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  31.54 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  46.38 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.04 
 
 
471 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  28.89 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  28.15 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  35.59 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7293  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  34.29 
 
 
472 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  44.44 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.16 
 
 
472 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.81 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5047  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
471 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2098  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.84 
 
 
493 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1955  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.86 
 
 
472 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435715  normal  0.221917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.09 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  31.62 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.09 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  39.08 
 
 
343 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  29.46 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  27.34 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  48.39 
 
 
339 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  46.27 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  32.14 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  28.99 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  30.23 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  34.75 
 
 
130 aa  58.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  28.99 
 
 
156 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  24.65 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  40.54 
 
 
163 aa  57.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  33.9 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0287  dehydratase  32.12 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  29.32 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1790  maoC family protein  35.59 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1929  MaoC family protein  35.59 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.988718  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  29.08 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  30.51 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0121  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.57 
 
 
476 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2655  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.57 
 
 
467 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1058  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.57 
 
 
467 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0145  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.57 
 
 
467 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.880803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2798  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.57 
 
 
467 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>