33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1919 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  470  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  55.7 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  54.85 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  52.12 
 
 		 255 aa  241  5e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  41.98 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  36.36 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  36.99 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  34.76 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  34.76 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  34 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  36.55 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  33.5 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  35.35 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  33 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  35.35 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  33.81 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  36.31 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  32.46 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  36 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  37.84 
 
 		 247 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  35.03 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  35.16 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  34.47 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  30.15 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  34.64 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  34.64 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  34.64 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  37.91 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  37.91 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  37.91 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  29.72 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  29.26 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>