More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1909 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1909  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
329 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260118  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  85.54 
 
 
325 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0360  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.77 
 
 
325 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.77 
 
 
325 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2615  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.65 
 
 
329 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00219315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0490  alcohol dehydrogenase  65.54 
 
 
325 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0464  alcohol dehydrogenase  64.62 
 
 
325 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1779  alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
321 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.31 
 
 
332 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1926  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.19 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4742  alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 
344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0239  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  41.52 
 
 
321 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.16 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53110  oxidoreductase  37.8 
 
 
319 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4095  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4656  oxidoreductase  38.91 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0207  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
327 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3759  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.93 
 
 
318 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2768  alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.98 
 
 
328 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.09 
 
 
335 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.16 
 
 
328 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.21 
 
 
328 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.78 
 
 
327 aa  99  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.05 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.03 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2634  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.65 
 
 
336 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.04 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
332 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4404  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.85 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.880778 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.07 
 
 
331 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.94 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.71 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  27.67 
 
 
325 aa  92.8  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.75 
 
 
331 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.93 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.66 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.95 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6140  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.81 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.62 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  26.84 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5053  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.66 
 
 
324 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1258  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
340 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.46 
 
 
333 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0908674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.08 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3235  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
333 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.721044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.53 
 
 
330 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1357  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.87 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.27 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3909  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.2 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  32.19 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4426  alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.75 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.58 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  30.13 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1848  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  29.58 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2710  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  27.13 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  28.01 
 
 
2225 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2217  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.25 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.86 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.26 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  28.57 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  28.35 
 
 
2220 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1501  alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640721  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.78 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.8 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2970  Beta-ketoacyl synthase  29.48 
 
 
1841 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.3 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.14 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.79 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.21 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103733  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.29 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.6 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14300  putative zinc-binding oxidoreductase  28.91 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.84 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  29.18 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.6 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.77 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.81 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>