26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1713 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  100 
 
 		 149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  69.8 
 
 		 157 aa  214  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  51.01 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  42.96 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  42.96 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  44.03 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  36.52 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  44 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  30.83 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  29.55 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  42.67 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  30.3 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  37.8 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  30.12 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  37.36 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 361 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  26.92 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  25.35 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  42 
 
 		 202 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  42.22 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>