More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1593 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1593  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.071648  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  72.97 
 
 		 315 aa  243  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  38.86 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  38.86 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 301 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 330 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 302 aa  114  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4265  transcriptional regulator, LysR family  41.56 
 
 		 315 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.562442 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4153  transcriptional regulator, LysR family  41.56 
 
 		 315 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2189  transcriptional regulator, LysR family  46.4 
 
 		 308 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 311 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 307 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1127  LysR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 305 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4759  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 314 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.983634  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 307 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 309 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 297 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 302 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 302 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 305 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 302 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01787  transcription regulator protein  40.44 
 
 		 297 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.933146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2154  LysR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 305 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224535  normal  0.610808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 317 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 317 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 303 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 324 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0756  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 305 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 300 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 324 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 309 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2753  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 300 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 324 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0958  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 303 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1052  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 303 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1018  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 303 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0965  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 314 aa  98.2  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292002  normal  0.0128926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0986  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 303 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1067  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 303 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 329 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1781  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 313 aa  97.4  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 301 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 322 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 301 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 323 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 324 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1033  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 305 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1029  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 305 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 330 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 312 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 325 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4092  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 305 aa  95.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 330 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05302  transcription regulator protein  40.94 
 
 		 329 aa  95.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 325 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  35.94 
 
 		 301 aa  94.7  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 336 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1472  LysR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 301 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 321 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 325 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 323 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 330 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 323 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2889  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 300 aa  91.3  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2104  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 301 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1151  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 305 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1994  LysR family substrate binding transcriptional regulator  37.04 
 
 		 301 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415294  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2357  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  37.04 
 
 		 301 aa  90.5  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1541  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 309 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0672  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 305 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2964  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 304 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3986  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 305 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0225  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 303 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3744  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 305 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5304  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 303 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4821  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 305 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5499  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 297 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2605  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 302 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.983354  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4915  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 300 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5249  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 303 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5159  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 303 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 311 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4416  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 309 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05463  transcription regulator protein  34.06 
 
 		 305 aa  84.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.163697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39160  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 311 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.255585  normal  0.408672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1481  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2842  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 322 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1262  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 300 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  36.23 
 
 		 293 aa  81.3  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1955  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 310 aa  81.3  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0559  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2451  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1746  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 303 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2763  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1774  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.793189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2822  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2830  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>