More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1971 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  100 
 
 		 394 aa  763    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  31.09 
 
 		 412 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  27.44 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  29.31 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  27.79 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  26.92 
 
 		 400 aa  156  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  26.65 
 
 		 407 aa  156  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  27.87 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  27.76 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  26.62 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  26.38 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  26.07 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  26.54 
 
 		 503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  27.49 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  26.56 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  26.72 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  27.17 
 
 		 495 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  30.59 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  25.19 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.56 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  29.18 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  27.22 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  27.65 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.88 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  27.72 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  24.52 
 
 		 503 aa  112  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  24.82 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  33.33 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  27.75 
 
 		 456 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  24.75 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  27.75 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  24.81 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  27.5 
 
 		 456 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  26.45 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  29.1 
 
 		 381 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  29.43 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  27.33 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  23.66 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  39.57 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  26.62 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  26.82 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  26.12 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  24.32 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  27.37 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  26.75 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  23.89 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  24.12 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  23.7 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  24.43 
 
 		 438 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  25.77 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  28.83 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  25.77 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  25.77 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  24.16 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  25.77 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  25.77 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  25.77 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  27.7 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  25.77 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  25.77 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  25.77 
 
 		 427 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  30.82 
 
 		 372 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  27.23 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  23.98 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  24.49 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  23.98 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  24.49 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  20.9 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  24.58 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  36.57 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  24.74 
 
 		 427 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  25 
 
 		 381 aa  93.6  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  36.57 
 
 		 372 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  30.62 
 
 		 516 aa  92.8  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  26.01 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  28.32 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.25 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  29.84 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  28.32 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  25.19 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  25.56 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  24.35 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  18.37 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  24.47 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  28.72 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  22.85 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  22.6 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  22.22 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  25.48 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  23.8 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  23.44 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  25.74 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  32.09 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  23.51 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  23.51 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  23.62 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>