113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1928 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1928  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 117 aa  228  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0015663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1629  preprotein translocase subunit SecG  39.09 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000355121  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0720  preprotein translocase subunit SecG  36.79 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1628  preprotein translocase subunit SecG  40.95 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.732885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  34.91 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  37.27 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  43.24 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  43.24 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  33.88 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1531  preprotein translocase subunit SecG  42.68 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  41.43 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  41.43 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  41.43 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  29.82 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5920  preprotein translocase, SecG subunit  37.86 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0413525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  26.72 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  40.54 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  40.54 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  28.57 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  27.93 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  30.47 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  30.51 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  25.86 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  25.86 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  25.86 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  34.74 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  40.58 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  25.93 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0931  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 115 aa  47.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  25 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  43.06 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  30.7 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  39.44 
 
 		 74 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  29.82 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1845  preprotein translocase, SecG subunit  36.36 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  24.14 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  32.1 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  27.78 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  34.72 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  25.45 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  36.76 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  46.55 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  25.45 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  30.19 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  29.59 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  39.68 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  26.36 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  35.16 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1825  preprotein translocase subunit SecG  30.3 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.713592  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  26.5 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  30.63 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  30.63 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  25.74 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  25.74 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  25.74 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  25.74 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  25.74 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  25.74 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  26.67 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  25.74 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0812  preprotein translocase, SecG subunit  32.95 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.184287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  25.74 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  30.43 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  28.57 
 
 		 102 aa  43.9  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  30.28 
 
 		 105 aa  43.9  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  26.4 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0315  preprotein translocase, SecG subunit  37.25 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1154  preprotein translocase, SecG subunit  29.07 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  43.1 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  36.51 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  36.51 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  24.53 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  31.31 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0441  preprotein translocase, SecG subunit  35.14 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00696094  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  29.73 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0456  preprotein translocase, SecG subunit  35.14 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  29.36 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  32.26 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  24.77 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  35.53 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0967  preprotein translocase subunit SecG  29.85 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  25.71 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  24.77 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  24.77 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0498  preprotein translocase, SecG subunit  34.82 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  24.77 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  40.3 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0602  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  28.18 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  24.77 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>