111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0812 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0812  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 100 aa  199  9e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.184287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1154  preprotein translocase, SecG subunit  41.41 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  37.37 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  38.27 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  36.26 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  31.31 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  35.79 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  35.42 
 
 		 124 aa  57  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  29.29 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  29.29 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  36 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  30.21 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  35.29 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  29.29 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  30.21 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  29 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  29.41 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  29.29 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  43.84 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  32.26 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  35.63 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  37.84 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  37.84 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  37.84 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  24.49 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  37.84 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  30.86 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  33.73 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  31.25 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  25.88 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  30.49 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  31.71 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  29.17 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  28.4 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  28.4 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  28.4 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  32.58 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  32.43 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  31.08 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  30.77 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  33.78 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  32.43 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  29.7 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  24.51 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  28.28 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  28.75 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  31.08 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  44.44 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  32.43 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  44.44 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1238  preprotein translocase subunit SecG  36.96 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  32.94 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  30.86 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  30.86 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  35.21 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  36.23 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  31.94 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  37.5 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  34.78 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0635  protein-export membrane protein secG  31.67 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.692844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  28.4 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0498  preprotein translocase, SecG subunit  30.85 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  37.36 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  28.4 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  27.47 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  29.41 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  34.52 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  34.52 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  34.52 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0820  preprotein translocase, SecG subunit  39.76 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>