48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1613 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
77 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  60.81 
 
 
76 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  60 
 
 
76 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  63.51 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  54.55 
 
 
77 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  53.42 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  50.7 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  52.86 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  46.84 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  58.06 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  46.58 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  44.62 
 
 
77 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  43.08 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  43.08 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  47.14 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  47.54 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  50.68 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  39.13 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0916  preprotein translocase, SecG subunit  42.25 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  43.55 
 
 
83 aa  50.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  54 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  41.67 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  33.78 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1722  preprotein translocase, SecG subunit  39.44 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  40.28 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  41.54 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  40.28 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  40.28 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  40.28 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  33.85 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  41.54 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>