43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0441 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0456  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
76 aa  147  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0441  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
76 aa  147  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00696094  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1722  preprotein translocase, SecG subunit  63.38 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0178  preprotein translocase, SecG subunit  59.21 
 
 
76 aa  93.6  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00100045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  41.33 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  35.53 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  35.53 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  38.36 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  40.54 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  43.08 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  34.62 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  31.58 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  33.8 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  33.82 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  31.51 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 
77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  27.63 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 
133 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 
133 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  34.25 
 
 
203 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 
77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0059  preprotein translocase, SecG subunit  47.46 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  42.65 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  29.58 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  36.07 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  43.28 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  41.18 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 
77 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>