100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1722 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1722  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 77 aa  150  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000381518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0456  preprotein translocase, SecG subunit  63.38 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0441  preprotein translocase, SecG subunit  63.38 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00696094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0178  preprotein translocase, SecG subunit  57.53 
 
 		 76 aa  87.8  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00100045  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  42.47 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  42.47 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0059  preprotein translocase, SecG subunit  49.18 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  40.91 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  40.91 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  40.91 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  40.91 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  39.39 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  39.39 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  39.39 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  42.67 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  36.92 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  46.27 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  36.11 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  36.23 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  35.38 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  40.28 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  34.85 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  38.57 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  32.88 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  35.62 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  33.85 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  33.85 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  33.85 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  33.85 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  33.85 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  46.48 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  38.36 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  36.62 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  36.76 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  33.85 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  33.85 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  35.62 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  32.31 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  33.85 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  33.85 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  33.85 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  40.91 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  30.3 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  39.44 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  42.03 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  42.03 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  32.31 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  37.31 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  35.38 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  36.11 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  32.31 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  32.31 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  37.88 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  32.31 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 120 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  34.25 
 
 		 152 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  30.3 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  32.88 
 
 		 123 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  37.7 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  34.25 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  31.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2063  preprotein translocase subunit SecG  37.88 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0208548  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  28.79 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  31.08 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  34.85 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  36.11 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  40.98 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>