50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2986 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
76 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  71.05 
 
 
75 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  65.79 
 
 
76 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  55.26 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  60 
 
 
77 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  61.11 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  55.41 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  58.82 
 
 
83 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  60.61 
 
 
73 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  53.95 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  57.53 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  48 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  52.24 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  56.36 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  56.36 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  68 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  42.47 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  43.55 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  43.55 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  41.54 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  43.55 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  43.55 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  43.55 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  43.55 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  43.55 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  43.55 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  41.54 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  46.43 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  43.66 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  53.03 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  43.48 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  39.73 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  43.48 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  42.25 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  42.86 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  42.25 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  46.38 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  46.38 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  42.03 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  42.86 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  33.78 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0745  preprotein translocase, SecG subunit  55.56 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1722  preprotein translocase, SecG subunit  42.11 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000381518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  37.68 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  39.71 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  40.58 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  43.08 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>