27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0059 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0059  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
78 aa  152  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1722  preprotein translocase, SecG subunit  50.67 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000381518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0456  preprotein translocase, SecG subunit  44.29 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0441  preprotein translocase, SecG subunit  44.29 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00696094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0178  preprotein translocase, SecG subunit  43.06 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00100045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  36.23 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  32.39 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  33.8 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  31.58 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  31.43 
 
 
132 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  28.95 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  31.43 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  37.31 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  29.58 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  30 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  28.38 
 
 
130 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>