81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0178 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0178  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 76 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00100045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0441  preprotein translocase, SecG subunit  59.21 
 
 		 76 aa  93.6  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00696094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0456  preprotein translocase, SecG subunit  59.21 
 
 		 76 aa  93.6  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1722  preprotein translocase, SecG subunit  57.53 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000381518  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  43.42 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  43.42 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  42.31 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  42.31 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  41.67 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  36.99 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  39.73 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  39.73 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  38.89 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  44.93 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  42.03 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  43.24 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  43.33 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  42.03 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0059  preprotein translocase, SecG subunit  48.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  35.62 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  38.96 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  37.31 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  36.11 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  36.76 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  42.67 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1024  preprotein translocase, SecG subunit  40.79 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00245496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  42.03 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4715  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  40 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  38.24 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  33.78 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  39.19 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4580  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  38.36 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  34.78 
 
 		 122 aa  42  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  34.33 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  34.25 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  37.31 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0718  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106804 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  34.25 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  42.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  40.3 
 
 		 114 aa  42  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  35.82 
 
 		 128 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  34.29 
 
 		 137 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  40.3 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  37.31 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  37.68 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  35.82 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  32.88 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  35.82 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2063  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0208548  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  38.24 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>