21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1166 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 741 aa  1519    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  40.95 
 
 		 736 aa  551  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3104  heparinase II/III family protein  41.88 
 
 		 760 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11508  putative chondroitin AC/alginate lyase  38.56 
 
 		 759 aa  543  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0906796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  37.19 
 
 		 748 aa  535  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2067  Heparinase II/III family protein  42.8 
 
 		 744 aa  535  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.720952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  40.77 
 
 		 722 aa  525  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46500  alginate lyase  43.18 
 
 		 742 aa  512  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  26.15 
 
 		 672 aa  101  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  26.15 
 
 		 672 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  26.15 
 
 		 672 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0489  heparinase II/III family protein  22.06 
 
 		 622 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3334  Heparinase II/III family protein  27.34 
 
 		 1064 aa  70.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.503673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3344  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1064 aa  68.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  30.43 
 
 		 968 aa  54.7  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  24.38 
 
 		 657 aa  51.2  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0331  Heparinase II/III family protein  24.66 
 
 		 1005 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2409  Heparinase II/III family protein  28.07 
 
 		 818 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0606  Heparinase II/III family protein  21.38 
 
 		 705 aa  47.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  31.01 
 
 		 675 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  19.92 
 
 		 628 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>