15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11508 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  57.76 
 
 		 748 aa  917    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11508  putative chondroitin AC/alginate lyase  100 
 
 		 759 aa  1582    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0906796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  40.97 
 
 		 736 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46500  alginate lyase  40.89 
 
 		 742 aa  572  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  40.03 
 
 		 722 aa  557  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  38.56 
 
 		 741 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2067  Heparinase II/III family protein  39.28 
 
 		 744 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.720952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3104  heparinase II/III family protein  39.84 
 
 		 760 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  24.58 
 
 		 672 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  24.58 
 
 		 672 aa  97.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  24.58 
 
 		 672 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0489  heparinase II/III family protein  23.65 
 
 		 622 aa  62.4  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0606  Heparinase II/III family protein  24.62 
 
 		 705 aa  54.3  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  30.61 
 
 		 968 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  22.8 
 
 		 627 aa  51.2  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>