15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2409 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2409  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 818 aa  1703    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3344  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1064 aa  67.4  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3334  Heparinase II/III family protein  28.1 
 
 		 1064 aa  62  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.503673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  27.7 
 
 		 761 aa  55.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0331  Heparinase II/III family protein  23.95 
 
 		 1005 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  28.26 
 
 		 748 aa  52  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0251  heparinase II/III-like  32.04 
 
 		 772 aa  50.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.884612  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  20.26 
 
 		 672 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  20.26 
 
 		 672 aa  50.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  20.26 
 
 		 672 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  26.36 
 
 		 736 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  23 
 
 		 722 aa  48.5  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  28.07 
 
 		 741 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  26.9 
 
 		 594 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2067  Heparinase II/III family protein  25.9 
 
 		 744 aa  44.3  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.720952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>