16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3651 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  100 
 
 		 748 aa  1544    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11508  putative chondroitin AC/alginate lyase  56.22 
 
 		 759 aa  919    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0906796  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  41.3 
 
 		 722 aa  573  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3104  heparinase II/III family protein  39.31 
 
 		 760 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220096  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  38.5 
 
 		 736 aa  547  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46500  alginate lyase  40.54 
 
 		 742 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2067  Heparinase II/III family protein  39.28 
 
 		 744 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.720952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  37.12 
 
 		 741 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  22.94 
 
 		 672 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  22.94 
 
 		 672 aa  110  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  22.94 
 
 		 672 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  23.93 
 
 		 968 aa  57  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0489  heparinase II/III family protein  25.53 
 
 		 622 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2409  Heparinase II/III family protein  28.26 
 
 		 818 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  28.06 
 
 		 627 aa  45.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3344  hypothetical protein  20.6 
 
 		 1064 aa  44.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>