16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3104 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  49.79 
 
 		 736 aa  713    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3104  heparinase II/III family protein  100 
 
 		 760 aa  1573    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  46.14 
 
 		 722 aa  674    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2067  Heparinase II/III family protein  48.91 
 
 		 744 aa  663    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.720952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46500  alginate lyase  47.99 
 
 		 742 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  39.75 
 
 		 748 aa  548  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  42.48 
 
 		 741 aa  544  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11508  putative chondroitin AC/alginate lyase  39.84 
 
 		 759 aa  538  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0906796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  25.32 
 
 		 672 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  25.38 
 
 		 672 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  26.65 
 
 		 672 aa  102  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0489  heparinase II/III family protein  27.57 
 
 		 622 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0606  Heparinase II/III family protein  30.13 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3334  Heparinase II/III family protein  27.1 
 
 		 1064 aa  58.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.503673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0331  Heparinase II/III family protein  22.49 
 
 		 1005 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  24.47 
 
 		 968 aa  44.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>