45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0938 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0938  NUDIX hydrolase  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244188  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1760  NUDIX hydrolase  64.08 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1482  NUDIX hydrolase  63.38 
 
 
151 aa  180  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  61.9 
 
 
148 aa  180  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0858  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
144 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460761 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0490  mutT/nudix family protein  36.62 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  36.17 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4771  mutT/nudix family protein  34.04 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  34.75 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  31.91 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4772  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4754  mutT/nudix family protein  35.61 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3633  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2640  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249433  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 
172 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  29.55 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  40.58 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  29.5 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  51.22 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  37.25 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  48.78 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  53.66 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  28.06 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  35.21 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1947  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00431661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>