208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5657 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 594 aa  1178    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  62.56 
 
 		 571 aa  712    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  62.56 
 
 		 571 aa  712    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  96.13 
 
 		 594 aa  1143    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  89.39 
 
 		 594 aa  1075    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  51.68 
 
 		 559 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  49.92 
 
 		 560 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  49.51 
 
 		 562 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  46.06 
 
 		 546 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  45.95 
 
 		 545 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  48.14 
 
 		 551 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  48.14 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  48.14 
 
 		 551 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  48.14 
 
 		 551 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  48.14 
 
 		 551 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  48.14 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  48.14 
 
 		 551 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  46.4 
 
 		 555 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  46.62 
 
 		 551 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  47.7 
 
 		 551 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  46.51 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  46.45 
 
 		 551 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  46.51 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  46.62 
 
 		 551 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  46.34 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  46.34 
 
 		 551 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  45.82 
 
 		 551 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  35.62 
 
 		 541 aa  334  3e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  30.36 
 
 		 508 aa  133  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  32.24 
 
 		 500 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  28.74 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  25 
 
 		 483 aa  62  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  28.84 
 
 		 476 aa  62  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  24.02 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  26.09 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 468 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 490 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  24.06 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  26.38 
 
 		 488 aa  55.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 491 aa  54.3  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 474 aa  54.3  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  28.99 
 
 		 474 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  25.51 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  28.99 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  28.99 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  28.99 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  28.99 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0805  amino acid permease family protein  28.99 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  28.99 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0845  amino acid permease family protein  28.99 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  24.36 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  28.99 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.94 
 
 		 471 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 465 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 473 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1782  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 473 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.78 
 
 		 471 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 465 aa  51.6  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 465 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 500 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 566 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 		 503 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.11 
 
 		 471 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 502 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.11 
 
 		 471 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  24.08 
 
 		 465 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  24.08 
 
 		 465 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 465 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 444 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 465 aa  50.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.66 
 
 		 471 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 465 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 465 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.66 
 
 		 471 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.71 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.71 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.71 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  27 
 
 		 480 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  25.44 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  25.44 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.77 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.77 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 499 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.77 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.77 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 492 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>