33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5558 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  45.79 
 
 
108 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  45.79 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  43.4 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  37.25 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  40 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  38.46 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  39.45 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  39.05 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  36.45 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  37.14 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  42.73 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  35.58 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  28.83 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  28.83 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  34.69 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  33.77 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0681  hypothetical protein  28.97 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  29.81 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  32.43 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  30.93 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  23.47 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.8 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  29.29 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0241  hypothetical protein  25.49 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>