23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3933 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  51.03 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  50.34 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  45.88 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  50.34 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  50.34 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  50.34 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  41.78 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  43.36 
 
 		 233 aa  94.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  36.67 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  38.06 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  36.09 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  36.73 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  36.73 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  34.88 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  31.29 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  31.29 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  29.28 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  29.28 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  29.28 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  29.28 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  29.03 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  29.59 
 
 		 886 aa  42  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>