35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3074 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0009  hypothetical protein  64.27 
 
 		 589 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0280  hypothetical protein  52.15 
 
 		 602 aa  672    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3074  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1233    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  42.19 
 
 		 600 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0752  Abortive phage infection  34.83 
 
 		 684 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  37.45 
 
 		 699 aa  336  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0571  hypothetical protein  35.36 
 
 		 661 aa  336  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  32.35 
 
 		 654 aa  257  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0938  hypothetical protein  28.7 
 
 		 672 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1249  hypothetical protein  30.17 
 
 		 658 aa  227  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0525958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  30.3 
 
 		 706 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  34.12 
 
 		 564 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  31.14 
 
 		 583 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  31.98 
 
 		 589 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  28.82 
 
 		 591 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  28.77 
 
 		 659 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  30.04 
 
 		 594 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  30.41 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  24.78 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  28.48 
 
 		 567 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  31.94 
 
 		 554 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  29.25 
 
 		 571 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  30.95 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  27.98 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  31.43 
 
 		 599 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  29.03 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  26.29 
 
 		 571 aa  55.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  27.98 
 
 		 583 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0934  hypothetical protein  28.08 
 
 		 587 aa  54.3  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0606328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  26.17 
 
 		 558 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23140  hypothetical protein  29.23 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  26.92 
 
 		 628 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  29.06 
 
 		 564 aa  51.2  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  30.07 
 
 		 588 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  27.94 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>